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洗滌室用于玻璃器皿、實驗用具的清洗、干燥、培養材料清洗、預處理也可在本室完成,面積一般在40-60平米。室內應建造大型水槽和一個或幾個浸泡池,水槽最好上一內襯白瓷片的水泥槽,為防止碰壞玻璃器皿,下面可鋪一活動的橡膠板。備有晾瓶架,用于放置刷凈的培養器皿,配備有一定數量的周轉盤或小推車,用于運輸培養器皿。地面要注意防滑,排水通暢,墻壁要有耐濕、防潮功能。