洗滌室用于玻璃器皿、實驗用具的清洗、干燥、培養材料清洗、預處理也可在本室完成，面積一般在40-60平米。室內應建造大型水槽和一個或幾個浸泡池，水槽最好上一內襯白瓷片的水泥槽，為防止碰壞玻璃器皿，下面可鋪一活動的橡膠板。備有晾瓶架，用于放置刷凈的培養器皿，配備有一定數量的周轉盤或小推車，用于運輸培養器皿。地面要注意防滑，排水通暢，墻壁要有耐濕、防潮功能。